El Centro Universitario de la Ciénega cuenta con una serie de convenios con los diferentes sectores del país y sectores a nivel nacional e internacional, en los cuales se involucran directamente a profesores y LGAC vinculados con el Doctorado en Ciencias de la Ingeniería. En la mayoría de los casos la vinculación es implícita, es decir no existe un convenio firmado entre las instituciones, sin embargo existe vinculación y colaboración para el desarrollo de proyectos, asesorías o intercambios académicos, de los cuales se obtienen resultados tales como publicaciones. Entre estos convenios se encuentran:
- Sandia National Laboratories.
- Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
- Centro de Investigación y de Estudios Avanzados - CINVESTAV del IPN, Unidad Guadalajara.
- University of L'Aquila, Dept. of Electric and Information Engineering.
- Universidad de Guanajuato.
- Universidad Autónoma de Baja California.
- Centro de Investigaciones en Óptica.
- Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco, A. C. (CIATEJ).
- Instituto Tecnológico de Ocotlán.
- Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías, Universidad de Guadalajara.
- Laboratoire de Rheologie, Université Joseph Fourier.
- Área de catálisis del Departamento de Química, en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Iztapalapa, CDMX
- Instituto Politécnico Nacional
- Instituto Tecnológico de Tepic
- Instituto Tecnológico de Sonora
